Download script

Jmol

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре

#

Имена атомов

Длина связи (Å)

Угол N-H-O (°)

Альфа-спирали

1

N(313ALA)-O(309LEU)

3.0

159

2

N(316ALA)- O(312ALA)

2.97

149.4

3

N(311GLU)- O(307PRO)

2.99

165.0

Бета-тяжи

1

N(99GLN)- O(55VAL)

2.27

158.6

2

N(58THR)- O(99GLN)

2.87

145.7

3

N(54VAL)- O(21ILE)

3.0

173.6

В альфа-спирали(на основе полученных данных): Средняя длина водородной связи= 2.98А Средний угол водородной связи= 157.8 В бета-тяжах (на основе полученных данных): Средняя длина водородной связи= 2.7А Средний угол водородной связи= 159.3 Полученные длины водородных связей близки к ожидаемыми данными(2.5-3.2A), углы также близки к идеальным(180)[2]. Литература: [1]http://biomodel.uah.es/en/water/hbonds.htm - длина водородной связи [2]Definition of the hydrogen bond(IUPAC Recommendations 2011) - угол водородной связи