Краткое описание бактерии Kytococcus sedentarius
Таксономия:
Империя: Bacteria
Тип: Actinobacteria
Класс: Actinobacteria
Порядок: Actinomycetales
Cемейство: Dermacoccaceae
Род: Kutococcus
Вид: Kytococcus sedentarius
Описание бактерии Kytococcus sedentarius:
Бактерия представляет собой маленькие грамположительные сферические клетки, которые располагаются поодиночке или в кубических скоплениях по 8 штук. Выделена была из морской среды в 1944 году в районе Сан Диего. Она является единственным из известных производителей антибиотиков monesin A и B. Как правило, клетки неподвижны и не образуют эндоспор. По способу дыхания бактерии аэробны. Оптимальная температура для роста и развития бактерии 25-30°С. Пигменты, выделяемые этими бактериями, не диффундируют в среду и не растворимы в воде. Содержат гликоген, который выполняет роль запасного вещества клетки.Секвенирование генома:
Геном бактерии секвенировали, потому что она является единственным из известных производителей антибиотиков monesin A и B. Секвенировали геном методом Сэнгера в Национальном центре биотехнологической информации, Бетесда, Мэриленд, США.Статистика генома
| Характеристика | Величина | Всего в (%) |
| Размер генома | 2,785,024 | |
| Область кодирующая ДНК | 2,558,989 | 91.88% |
| Кол-во репликонов | 1 | |
| Внехромосомные элементы | 1 | |
| Всего генов | 2703 | 100% |
| РНК генов | 64 | 2.37% |
| Белок-кодирующих генов | 2639 | 97.63% |
| Псевдогенов | 84 | 3.11% |
| Гены с сигнальными пептидами | 539 | 19.94% |
| CRISPR повторов | 0 |
Статья из PubMed
Название статьи:
Полная последовательность генома штамма типа Kytococcus sedentarius (541).Авторы:
Sims D, Brettin T, Detter JC, Han C, Lapidus A, Copeland A, Glavina Del Rio T, Nolan M, Chen F, Lucas S, Tice H, Cheng JF, Bruce D, Goodwin L, Pitluck S, Ovchinnikova G, Pati A, Ivanova N, Mavrommatis K, Chen A, Palaniappan K, D'haeseleer P, Chain P, Bristow J, Eisen JA, Markowitz V, Hugenholtz P, Schneider S, Gцker M, Pukall R, Kyrpides NC, Klenk HP.Аннотация:
Kytococcus sedentarius является типичным штаммом своего вида и интересенa с филогенетической точки зрения из-за особенности местаположения в Dermacoccaceae, плохо изученного семейства входящего в подотряд Micrococcineae. Kytococcus sedentarius известенa, потому что производит олигокетидные антибиотики, а так же известенa в роли оппотурнистического патогена, вызывающего эндокардит, геморрагическую пневмонию и точечный кератолизис. Это строго аэробная бактерия, которая способна расти только при условии наличия некоторых аминокислот в определенной их концентрации. Штамм описывается как свободноживущая, неподвижная, Грамм-положительная бактерия, изначально выделенная из морской среды. Здесь мы опишем особенности этого организма вместе с полной последовательностью генома и аннотацией. Это первая полная последовательность генома организма, относящегося к семейству Dermacoccaceae и эта последовательность, состоящая из 2,785,024 пар нуклеотидов, содержит 2639 протеин кодирующих и 64 РНК генов и является частью проекта "Геномная энциклопедия бактерий и архей".PMID: 21304632
Изображение данной бактерии
