Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)
Нахождение метаболических путей, в которых участвует мой фермент.
Мне был дан фермент тот же, что и в предыдущем задании (Q8TCB7). При помощм Swiss-Prot был найден идентификатор для KEGG - hsa:131965. В KEGG был произведен поиск метаболических путей. Для каждого из путей в таблице ниже приведены идентификаторы KEGG, русские и английские названия, структурные формулы. Карты самих путей приведены на рисунках ниже.
| идентификатор | английское название | русское название |
| hsa00340 | Histidine metabolism | метаболизм гистидина |
| hsa00350 | Tyrosine metabolism | метаболизм тирозина |
Нахождение в KEGG структурных формул заданного соединения
Мне было дано два соединения: аденин и гуанин. Был проведен поиск каждого из соединений по базе лигандов в KEGG. Данные о находках приведены в таблице ниже.
| русское название | английское название | идентификатор | структурная формула |
| аденин | Adenine | С00147 |  |
| гуанин | Guanine | С00242 |  |
Нахождение метаболического путя от одного заданного вещества к другому
Для выполнения задания необходимо на странице KEGG пройти по гиперссылке "KEGG PATHWAY", далее найти гиперссылку "Ssarch&Color Pathway". Там в поля запроса введем найденные в предыдущем упражнении идентификаторы соединений. Укажем, что хотим раскрасить первое соединение красным, а второе - зеленым. Из полученного списка карт мы выбираем только те, после названия которых указана цифра 2 (присутствуют оба соединения).
Определим направление найденного пути. Отметим этот путь на карте через промежуточные соединения желтым цветом. На данной карте путь пролегает от Аденина к Гуанину.
