Построение филогенетических деревьев
Отобранные бактерии
Название | Мнемоника |
---|---|
Shewanella denitrificans | SHEDO |
Pasteurella multocida | PASMU |
Haemophilus influenzae | HAEIN |
Proteus mirabilis | PROMH |
Escherichia coli | ECOLI |
Yersinia pestis | YERPE |
Serratia proteamaculans | SERP5 |
Скобочная формула
(SHEDO,((HAEIN,PASMU),(PROMH,(ECOLI,(SERP5,YERPE)))));
Изображение дерева
Ветви дерева
Дерево содержит следующие нетривиальные деревья:
{YERPE, SERP5} vs {SHEDO, HAIEN, PASMU, PROMH, ECOLI}
{YERPE, SERP5, ECOLI} vs {SHEDO, HAIEN, PASMU, PROMH}
{YERPE, SERP5, ECOLI, PROMH} vs {SHEDO, HAIEN, PASMU}
{YERPE, SERP5, ECOLI, PROMH, SHEDO} vs {HAIEN, PASMU}
Ветвь {YERPE, SERP5} соответствует семейству Yersiniaceae, ветвь {YERPE, SERP5, ECOLI, PROMH} - порядку Enterobacterales. Другая ветвь - {HAIEN, PASMU} соотвествует семейство Pasteurellaceae. Все листья дерева объединяет класс Gammaproteobacteria.