HEADER TRANSPORT PROTEIN TITLE L-LEUCINE-BINDING PROTEIN WITH PHENYLALANINE BOUND По-моему поля несут следующую информацию: HEADER - Класс молекулы. В данной случае - транспортный белок. Судя по PDB в этом поле могут быть самые разные классы от RNA до ферментов. TITLE - Название молекулы. В данном случае - L-лейцин связывающий белок со связанным фенилаланином. COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: LEUCINE-SPECIFIC BINDING PROTEIN; COMPND 3 SYNONYM: L-LEUCINE-BINDING PROTEIN, LS-BP, L-BP; COMPND 4 CHAIN: A, C; COMPND 5 ENGINEERED: YES Дальнейшие размышления. Строки 2 и 3 в поле COMPND представляют собой названия структуры и его синонимы (строка 3: SYNONIM). Важной является строка 4 CHAIN: несет информацию о цепях в данной белковой структуре и их идентификаторах, а данном случае цепи 2, что подтверждается 3D структурой, их идентификаторы - A и C. Строка ENGINEERED несет информацию о том, синтезирован ли данный белок искуственно или нет, в данном случае - да. Изучение поля SEQRES показало, что белок состоит из 2 абсолютно идентичных цепей, каждая из которых состоиз из 346 аминокислотных остатков. Анализ полей HET HETNAM и FORMUL дает следующую информацию. В каждой цепи в идинаковой позиции (A1346 и С1346) координированна 1 молекула фенилаланина (PHENYLALANINE). FORMUL 4 HOH *299(H2 O1) А вот над этой надписью стоит подумать. Судя по всему она означает, что в белке находятся 299 молекул воды (H2O). |
---|
Цепь А, красные - альфа-спирали, желтые - бета-тяжи В каждой цепи - 16 альфа спиралей и 7 бета-тяжей |
Белок в остовной модели, разные цепи показаны разными цветами, зеленым показаны лиганды |
©Арутюнов Артём
©Photo exclusiely made by myself :)