| * | 2 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| s | e | q | 1 | : | - | D | K | L | V | G | V | E | Y | D | D | A | C | D | P | K | Q | A | V | A | - | : | 1 | 9 | ||||
| s | e | q | 2 | : | K | D | K | L | V | Y | V | E | Y | D | D | A | C | - | P | H | Q | A | V | A | - | : | 1 | 9 | ||||
| D | K | L | V | V | E | Y | D | D | A | C | P | Q | A | V | A | * |
 |
Карта локального сходства, выданная программой bl2seq для выравнивания с моим белком (LIVK_ECOLI). как видно, моя последовательность - это остатки с 65 по 83, что соответствует скорее началу белка, чем его концу. Программа bl2seq почему-то не выранивала мою последовательность с гомологом. Также она не выравнивала две коротких последовательности. |
 |
Карта локального сходства белка LIVJ_ECOLI с моим белком - LIVK_ECOLI 76% Идентичности, 86% сходства. Так как белки очень похожи, то они выровнены полностью, поставлено всего лишь 2 гэпа. |
©Арутюнов Артём
©Photo exclusiely made by myself :)