|
Параметры выравнивания для стандартных значений (10 за открытие, 0.5 за продление гэпа) |
|
Параметры выравнивания с изменёнными значениями (20 за открытие, 1 за продление гэпа). Вес (Score) выравнивания, пусть немножко, но упал, что логично. |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
M |
K |
R |
N |
A |
K |
T |
I |
I |
A |
G |
M |
I |
A |
L |
A |
I |
S |
H |
T |
A |
M |
A |
D |
D |
I |
K |
V |
A |
V |
V |
G |
A |
M |
S |
G |
P |
I |
A |
Q |
W |
G |
D |
M |
E |
F |
N |
G |
A |
R |
Q |
A |
I |
K |
D |
I |
N |
A |
K |
G |
G |
I |
K |
G |
D |
K |
L |
V |
G |
V |
E |
Y |
D |
  |
: |
  |
  |
7 |
3 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
M |
N |
I |
K |
G |
K |
A |
L |
L |
A |
G |
C |
I |
A |
L |
A |
F |
S |
N |
M |
A |
L |
A |
E |
D |
I |
K |
V |
A |
V |
V |
G |
A |
M |
S |
G |
P |
V |
A |
Q |
Y |
G |
D |
Q |
E |
F |
T |
G |
A |
E |
Q |
A |
V |
A |
D |
I |
N |
A |
K |
G |
G |
I |
K |
G |
N |
K |
L |
Q |
I |
V |
K |
Y |
D |
  |
: |
  |
  |
7 |
3 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
M |
  |
  |
  |
  |
K |
  |
6 |
6 |
A |
G |
  |
I |
A |
L |
A |
  |
S |
  |
  |
A |
6 |
A |
  |
D |
I |
K |
V |
A |
V |
V |
G |
A |
M |
S |
G |
P |
6 |
A |
Q |
5 |
G |
D |
  |
E |
F |
  |
G |
A |
  |
Q |
A |
6 |
  |
D |
I |
N |
A |
K |
G |
G |
I |
K |
G |
1 |
K |
L |
  |
  |
V |
  |
Y |
D |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
8 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
0 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
2 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
D |
A |
C |
D |
P |
K |
Q |
A |
V |
A |
V |
A |
N |
K |
I |
V |
N |
D |
G |
I |
K |
Y |
V |
I |
G |
H |
L |
C |
S |
S |
S |
T |
Q |
P |
A |
S |
D |
I |
Y |
E |
D |
E |
G |
I |
L |
M |
I |
S |
P |
G |
A |
T |
N |
P |
E |
L |
T |
Q |
R |
G |
Y |
Q |
H |
I |
M |
R |
T |
A |
G |
L |
D |
S |
S |
  |
: |
  |
1 |
4 |
6 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
D |
A |
C |
D |
P |
K |
Q |
A |
V |
A |
V |
A |
N |
K |
V |
V |
N |
D |
G |
I |
K |
Y |
V |
I |
G |
H |
L |
C |
S |
S |
S |
T |
Q |
P |
A |
S |
D |
I |
Y |
E |
D |
E |
G |
I |
L |
M |
I |
T |
P |
A |
A |
T |
A |
P |
E |
L |
T |
A |
R |
G |
Y |
Q |
L |
I |
L |
R |
T |
T |
G |
L |
D |
S |
D |
  |
: |
  |
1 |
4 |
6 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
D |
A |
C |
D |
P |
K |
Q |
A |
V |
A |
V |
A |
N |
K |
6 |
V |
N |
D |
G |
I |
K |
Y |
V |
I |
G |
H |
L |
C |
S |
S |
S |
T |
Q |
P |
A |
S |
D |
I |
Y |
E |
D |
E |
G |
I |
L |
M |
I |
3 |
P |
  |
A |
T |
  |
P |
E |
L |
T |
  |
R |
G |
Y |
Q |
  |
I |
6 |
R |
T |
  |
G |
L |
D |
S |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
8 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
0 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
2 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
Q |
G |
P |
T |
A |
A |
K |
Y |
I |
L |
E |
T |
V |
K |
P |
Q |
R |
I |
A |
I |
I |
H |
D |
K |
Q |
Q |
Y |
G |
E |
G |
L |
A |
R |
S |
V |
Q |
D |
G |
L |
K |
A |
A |
N |
A |
N |
V |
V |
F |
F |
D |
G |
I |
T |
A |
G |
E |
K |
D |
F |
S |
A |
L |
I |
A |
R |
L |
K |
K |
E |
N |
I |
D |
F |
  |
: |
  |
2 |
1 |
9 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
Q |
G |
P |
T |
A |
A |
K |
Y |
I |
L |
E |
K |
V |
K |
P |
Q |
R |
I |
A |
I |
V |
H |
D |
K |
Q |
Q |
Y |
G |
E |
G |
L |
A |
R |
A |
V |
Q |
D |
G |
L |
K |
K |
G |
N |
A |
N |
V |
V |
F |
F |
D |
G |
I |
T |
A |
G |
E |
K |
D |
F |
S |
T |
L |
V |
A |
R |
L |
K |
K |
E |
N |
I |
D |
F |
  |
: |
  |
2 |
1 |
9 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
Q |
G |
P |
T |
A |
A |
K |
Y |
I |
L |
E |
  |
V |
K |
P |
Q |
R |
I |
A |
I |
6 |
H |
D |
K |
Q |
Q |
Y |
G |
E |
G |
L |
A |
R |
  |
V |
Q |
D |
G |
L |
K |
  |
  |
N |
A |
N |
V |
V |
F |
F |
D |
G |
I |
T |
A |
G |
E |
K |
D |
F |
S |
  |
L |
6 |
A |
R |
L |
K |
K |
E |
N |
I |
D |
F |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
8 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
V |
Y |
Y |
G |
G |
Y |
Y |
P |
E |
M |
G |
Q |
M |
L |
R |
Q |
A |
R |
S |
V |
G |
L |
K |
T |
Q |
F |
M |
G |
P |
E |
G |
V |
G |
N |
A |
S |
L |
S |
N |
I |
A |
G |
D |
A |
A |
E |
G |
M |
L |
V |
T |
M |
P |
K |
R |
Y |
D |
Q |
D |
P |
A |
N |
Q |
G |
I |
V |
D |
A |
L |
K |
A |
D |
K |
  |
: |
  |
2 |
9 |
2 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
V |
Y |
Y |
G |
G |
Y |
H |
P |
E |
M |
G |
Q |
I |
L |
R |
Q |
A |
R |
A |
A |
G |
L |
K |
T |
Q |
F |
M |
G |
P |
E |
G |
V |
A |
N |
V |
S |
L |
S |
N |
I |
A |
G |
E |
S |
A |
E |
G |
L |
L |
V |
T |
K |
P |
K |
N |
Y |
D |
Q |
V |
P |
A |
N |
K |
P |
I |
V |
D |
A |
I |
K |
A |
K |
K |
  |
: |
  |
2 |
9 |
2 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
V |
Y |
Y |
G |
G |
Y |
  |
P |
E |
M |
G |
Q |
6 |
L |
R |
Q |
A |
R |
  |
  |
G |
L |
K |
T |
Q |
F |
M |
G |
P |
E |
G |
V |
  |
N |
  |
S |
L |
S |
N |
I |
A |
G |
  |
  |
A |
E |
G |
6 |
L |
V |
T |
  |
P |
K |
  |
Y |
D |
Q |
  |
P |
A |
N |
  |
  |
I |
V |
D |
A |
6 |
K |
A |
  |
K |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
3 |
0 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
3 |
2 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
3 |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
3 |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
K |
D |
P |
S |
G |
P |
Y |
V |
W |
I |
T |
Y |
A |
A |
V |
Q |
S |
L |
A |
T |
A |
L |
E |
R |
T |
G |
S |
D |
E |
P |
L |
A |
L |
V |
K |
D |
L |
K |
A |
N |
G |
A |
N |
T |
V |
I |
G |
P |
L |
N |
W |
D |
E |
K |
G |
D |
L |
K |
G |
F |
D |
F |
G |
V |
F |
Q |
W |
H |
A |
D |
G |
S |
S |
  |
: |
  |
3 |
6 |
5 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
Q |
D |
P |
S |
G |
A |
F |
V |
W |
T |
T |
Y |
A |
A |
L |
Q |
S |
L |
Q |
A |
G |
L |
N |
Q |
- |
- |
S |
D |
D |
P |
A |
E |
I |
A |
K |
Y |
L |
K |
A |
N |
S |
V |
D |
T |
V |
M |
G |
P |
L |
T |
W |
D |
E |
K |
G |
D |
L |
K |
G |
F |
E |
F |
G |
V |
F |
D |
W |
H |
A |
N |
G |
T |
A |
  |
: |
  |
3 |
6 |
3 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
D |
P |
S |
G |
  |
5 |
V |
W |
  |
T |
Y |
A |
A |
6 |
Q |
S |
L |
  |
  |
  |
L |
  |
  |
  |
  |
S |
D |
  |
P |
  |
  |
6 |
  |
K |
  |
L |
K |
A |
N |
  |
  |
1 |
T |
V |
6 |
G |
P |
L |
  |
W |
D |
E |
K |
G |
D |
L |
K |
G |
F |
  |
F |
G |
V |
F |
  |
W |
H |
A |
1 |
G |
3 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
I |
V |
K |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
T |
A |
A |
K |
  |
: |
  |
3 |
6 |
9 |
L |
I |
V |
J |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
T |
D |
A |
K |
  |
: |
  |
3 |
6 |
7 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
T |
  |
A |
K |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
|
Выравнивание в GeneDoc. |