РSI-BLAST

2 мая 2008

Отчёт студента  I курса ФББ Арутюнова Артёма о выполнении практикума 11 второго семестра

 

Таблица 1.

Итерация PSI-BLAST	Число находок выше порога (E = 0,05)	Худшее E-value выше порога	Лучшее E-value ниже порога
1	22	0.002	0.082
2	24	3*10-10	1.5
3	24	10-19	1

 

 

Исходный белок

AC: P17160

ID: 133303

Probable sigma(54) modulation protein (ORF107).

Azotobacter vinelandii

 

Второй белок

AC: P26983                    

ID: 141386

Probable sigma(54) modulation protein (ORF95).

Salmonella typhimurium

 

 

Таблица 2.

Белок:	P17160	P26983
E-value (итерация 1):	2*10-56	4*10-23
E-value (итерация 2):	6*10-36	3*10-29
E-value (итерация 3):	10-34	3*10-29

 

 

Выводы и наблюдения: ...