Практикум 1. Филогенетическое дерево.

Задание 1

Таблица 1. Отобранные бактерии
Название Мнемоника
Acidothermus cellulolyticus ACIC1
Arthrobacter sp. ARTS2
Bifidobacterium longum BIFLO
Clavibacter michiganensis CLAMS
Corynebacterium diphtheriae CORDI
Corynebacterium efficiens COREF
Leifsonia xyli LEIXX

Скобочная формула дерева

((ACIC1,(BIFLO,(ARTS2,(LEIXX, CLAMS)))),(COREF,CORDI));

Изображение дерева

Sorry!
Рис 1. Дерево, содержащее вышеперечисленные виды.

Ветви дерева

Дерево содержит четыре нетривиальные ветви:

1) {LEIXX, CLAMS} против {ARTS2, ACIC1, BIFLO, COREF, CORDI}

2) {LEIXX,CLAMS, ARTS2} против {ACIC1, BIFLO, COREF, CORDI}

3) {LEIXX,CLAMS, ARTS2, BIFLO} против {ACIC1, COREF, CORDI}

4) {LEIXX,CLAMS, ARTS2, ACIC1, BIFLO}против {COREF, CORDI}

Таксономия

Таблица 1. Отобранные бактерии
Мнемоника вид род семейство порядок класс
ACIC1 Acidothermus cellulolyticus    Acidothermus Acidothermaceae; Acidothermales; Actinomycetia
ARTS2 Arthrobacter sp. Arthrobacter Micrococcaceae Micrococcales Actinomycetia
BIFLO Bifidobacterium longum Bifidobacterium Bifidobacteriaceae Bifidobacteriales Actinomycetia
CLAMS Clavibacter michiganensis Clavibacter Microbacteriaceae Micrococcales Actinomycetia
CORDI Corynebacterium diphtheriae Corynebacterium Corynebacteriaceae Corynebacteriales Actinomycetia
COREF Corynebacterium efficiens Corynebacterium Corynebacteriaceae Corynebacteriales Actinomycetia
LEIXX Leifsonia xyli Leifsonia Microbacteriaceae Micrococcales Actinomycetia

{LEIXX, CLAMS} - ветвь, выделяющая семейство Microbacteriaceae

{LEIXX,CLAMS, ARTS2} - ветвь, выделяющая порядок Micrococcales

{COREF, CORDI} - ветвь, выделяющая род Corynebacterium