Построение и анализ дерева, содержащего паралоги

Заданием было найти в отобранных бактериях достоверные гомологи белка CLPX_ECOLI и реконструировать дерево этих гомологов. С помощью выровненных последовательностей из Uniprot'а было построено филогенетическое дерево с помощью программы Mega 7 методом UPGMA.
Все данные предоставлены на рисунке ниже: