Отчёт

1. Итак, надо найти метаболический путь! Вбиваем в поиск map00565 и видим картинку с искомым путём (рис. 1):

   

2. Отметим цветом понравившуюся реакцию (рис. 2):

   

3. Данная реакция — гидролиз алкенилглицерофосфоэтаноламина на альдегид и глицерофосфоэтаноламин. Схема приведена на картинке (рис. 3):

   

4. Фермент, катализирующий реакцию, — плазмалогеназа (англ. lysoplasmalogenase).
5. По классификации ферментов имеем номер 3.3.2.2:
   • 3 — гидролаза;
   • 3.3 — гидролаза, катализирующая реакцию по связи типа простого эфира;
   • 3.3.2 — гидролаза 3.3, гидролизующая простые эфиры (а не, например, сульфиды — тиоэфиры);
   • 3.3.2.2 — плазмалогеназа (плазмалогены — фосфолипиды, у которых в первом положении глицерина простая эфирная связь с енолом, имеющим длинную алифатическую цепь).
6. Приведём данный путь для гладкой шпорцевой лягушки (Xenopus laevis, рис. 4) и сои (Glycine max, рис. 5).

   

   

7. Возьмём X. laevis. Открываем KEGG Pathway и вводим префикс xla. Поиск говорит, что имеется 168 путей с соответствующим префиксом. На главной странице напротив надписи KEGG Organisms вводим тот же код в окошко и попадаем к записи, где указано, что аннотировано 31644 генов белков и 42 гена РНК (всего 31686).