Краткое описание генома вируса Alternaria alternata virus-1

Alternaria alternata virus 1 - узко специализированный вирус, паразитирует на грибе Alternaria alternata.[1]

Alternaria alternata – широко распространенный гриб, относящийся к классу Ascomycetes, является возбудителем опасного заболевания картофеля и томата – альтернариоза, распространенного практически по всему ареалу возделывания этих культур.[2] A. alternata синтезируют специфические  к хозяину  токсины  (ХСТ),  благодаря  чему  они  легко  заражают  восприимчивые растения на  любой фазе их роста. Также этот гриб может вызывать инфекции верхних дыхательных путей и астму у людей с пониженным иммунитетом.[3]

Рис.1. Поражённые альтернариозом листья табака

В таблице 1 приведены параметры генома вируса [4]

Таблица 1:
Параметр Значение
Латинское название вируса Alternaria Alternata virus 1
Русское название вируса -
Количество фрагментов в полном геноме 4
Общая длина генома (п.н.) 10357
Количество кодируемых в геноме полипептидов 4

Самая короткая последовательность белка в геноме:
>YP_001976152.1 hypothetical protein
MFDSFCSFPAFVPFVLDDFSGRVSAPALLTVQATGGMKDGRQMA
TASIAFSGAVPSVDALDDDTLSCGVGRYIHHVHVDKVSFCGGAVCDKETCCSGCGVSS
VRPDPEGGFFSSASLGALVSAGLVEAGLEDERCTVMVSFGGLRIPLDATGGVVPHSRA
LDEAALGVFLPPPQTSDPGDVAVPNEPCDEEIKTLADGLLSHAVELGMPEQAAEASVV
VPLPPPPPDPEDLPGSAMNLGTLGGVLAAIADGSLVREIKTYDPPAGGFEGPRSEVLE
RRLQWLNALGSLSDSCYSVVADAGWYRLLLPFAHWQKQLGLLSGREMDLLLGGLSRVK
DPRLRADRYLHFLRTVVGASAGGVGDPPWAYGSVANFQVGMYRLLWPARGAKVGVGTS
A
	

Источники:
[1] Nanako Aoki, Hiromitsu Moriyama, A novel mycovirus associated with four double-stranded RNAs affects host fungal growth in Alternaria alternata
[2]https://en.wikipedia.org
[3]Л.Ю.Кокаева, Н.Н.Кудрявцева - Вирулентность штаммов Alternaria alternata к сортам картофеля и томата
[4] http://www.genome.jp
Официальный сайт ФББ МГУ
1 курс 1 семестр
© Kozyulina Svetlana 2016