Визуализация молекул в JMol

J(S)Mol апплет.

Приведенная ниже модель отображает кристаллическую структуру 5-,10-метилентетрагидрофолат дегидрогеназы-циклогидролазы (Кратье) (Pseudomonas aeruginosa).
Больше об этом белке можно узнать здесь

Текст скрипта: 5A88.spt

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре

№ Имена атомов Длина связи (Ангстрем) Угол N-O-C (°)

Альфа-спирали

1 N(317LEU)- O(313LYS) 2.90 158.0

2 N(314THR)- O(310ASP) 2.95 150.6

3 N(325HIS)- O(321ASP) 2.93 143.3

4 N(306VAL)- O(302GLN) 3.01 159.7

Бета-тяжи

1 N(254VAL)- O(223GLY) 2.81 162.7

2 N(223GLY)- O(254VAL) 3.00 139.2

3 N(209ALA)- O(269SER) 2.84 174.5

4 N(333PHE)- O(247ALA) 2.84 158.6

Средняя длина связи (Ангстрем) между атомами O и N равна для альфа-спирали - 2.95, а для бета-тяжей - 2.87.
Средний угол, образованный С=O--N атомами (°) равен для альфа-спирали - 152.90, а для бета-тяжей - 158.75.

© Svetlana Kozyulina, 2017

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
№	Имена атомов	Длина связи (Ангстрем)	Угол N-O-C (°)
Альфа-спирали
1	N(317LEU)- O(313LYS)	2.90	158.0
2	N(314THR)- O(310ASP)	2.95	150.6
3	N(325HIS)- O(321ASP)	2.93	143.3
4	N(306VAL)- O(302GLN)	3.01	159.7
Бета-тяжи
1	N(254VAL)- O(223GLY)	2.81	162.7
2	N(223GLY)- O(254VAL)	3.00	139.2
3	N(209ALA)- O(269SER)	2.84	174.5
4	N(333PHE)- O(247ALA)	2.84	158.6