Поиск по сходству (нуклеотидный blast)

1. Определите таксономию и функцию прочтенной вами нуклеотидной последовательности (из практ. 6)
Анализируемая нуклеотидная последовательность из прак. 6 (Прочтение последовательностей по Сэнгеру).

2. Сравните списки находок нуклеотидной последовательности 3-я разными алгоритмами blast.

3. Проверьте наличие гомологов трех белков в геноме одного организмов.
Для выполнения данного задания были выбраны белки TBB_NEUCR - тубулин, участвует в образовании микротрубочек, PRPC_EMENI - митохондриальная цитратсинтаза, EIF3G_SCHPO - фактор инициации трансляции eIF3g, содержит также РНК связывающий домен.

Ниже приведены файлы, полученные с помощью программы tblastn:
Для TBB_NEUCR, для PRPC_EMENI, для EIF3G_SCHPO.

4. Найдите один ген белка, закодированный в одном скэффолде ''Amoeboaphelidium protococcarum''.


© Kozyulina Svetlana 2017