Описание взаимодествий в структуре
1.Водородные связи
1.1. Водородные связи, затрагивающие остов белка
Данная струтура богата вторичными структурами, которые непосредственно поддерживаются за счет водороных связей.
Рисунок 1. Водородные связи, поддерживающие альфа спираль
Рисунок 2. Водородные связи, поддерживающие бета листы
1.2. Водородные связи, затрагивающие атомы боковых радикалов аминокислот
Кроме водородных связей между, атомами в остове белковой молекулы, в структуре присуствуют и водородные связи и в радикалах.
Рисунок 3. Водородные связи, с участием боковых радикалов
2. Солевые мостики
В составе струтуры присутствует множетсво заряженных аминокислот. Между разноименными зарядами на их радикалах возникают солевые мостики.
Рисунок 4. Солевой мостик
3. Дисульфидные связи
3. Дисульфидные связи
В данной структуре находится множество цистеинов, однако все они находятся на большом расстоении в 3D структуре. Наименьшее расстоение между двуями остатками цистеина >7A, поэтому взаимосдествия нигде не происходит.
Рисунок 5. Ближайшие остатки цистеина
В данной структуре множетсво ароматичсеких аминокислот, соответственно обнаружено множество взаимодествий ароматических систем.
