Контакты белка с ДНК

Работа с программой Rasmol



Исследованы контакты N-концевого домена белка PurR с одной цепью ДНК

Строение контактирующей молекулы:

Дезоксирибонуклеиновя кислота



Атомы, расположенные на расстоянии, меньшем, чем 3,1 ангстрем, выделены синим цветом.
Чёткой зависимости в расположении контактирующих остатков не наблюдается (только 2 из них расположены в спиралях и ещё 2 находятся на их концах).
Очевидно, наиболее важную роль при контакте играют водородные связи остатков с атомами кислорода в фосфатах двух соседних нуклеотидов.

ДНК и контактирующие с ней аминокислотные остатки