dna39.pdb
dna39.out
    2         # duplex
   12         # number of base-pairs
    1    1    # explicit bp numbering/hetero atoms
    1   24  0 #    1 | A:...1_:[..C]C-----G[..G]:..24_:B  1.10  0.24 20.84  8.77  0.07
    2   23  0 #    2 | A:...2_:[..G]G-----C[..C]:..23_:B  0.63  0.27  6.75  8.92 -0.33
    3   22  0 #    3 | A:...3_:[..C]C-----G[..G]:..22_:B  0.48  0.23  9.25  8.67 -0.55
    4   21  0 #    4 | A:...4_:[..A]A-----T[..T]:..21_:B  0.73  0.02  8.64  8.43 -0.72
    5   20  0 #    5 | A:...5_:[..T]T-----A[..A]:..20_:B  0.80  0.66 10.60  8.56  0.63
    6   19  0 #    6 | A:...6_:[..A]A-----T[..T]:..19_:B  1.25  0.19 23.10  9.05  0.12
    7   18  0 #    7 | A:...7_:[..T]T-----A[..A]:..18_:B  0.59  0.37 12.84  8.65 -0.18
    8   17  0 #    8 | A:...8_:[..A]A-----T[..T]:..17_:B  0.45  0.11 21.36  8.62 -0.84
    9   16  0 #    9 | A:...9_:[..T]T-----A[..A]:..16_:B  0.50  0.11 21.13  8.64 -0.77
   10   15  0 #   10 | A:..10_:[..G]G-----C[..C]:..15_:B  1.14  0.17  9.03  8.63 -0.02
   11   14  0 #   11 | A:..11_:[..C]C-----G[..G]:..14_:B  1.04  0.70 23.29  8.77  0.93
   12   13  0 #   12 | A:..12_:[..G]G-----C[..C]:..13_:B  0.77  0.66 23.80  9.01  0.60
##### Base-pair criteria used:   4.00 15.00  2.50 65.00  4.50  7.50 
##### 0 non-Watson-Crick base-pairs, and 1 helix (0 isolated bps)
##### Helix #1 (12): 1 - 12