Отчет по пр. 12

Имя строки	Информация	Комментарии
AC	PF20620
ID	Family of unknown function (DUF6805)	Функция неизвестна, соответственно и сказать тут нечего кроме длины - около 130 а.к
seed	40
full	744
proteins	3k
SW	0
architectures	84	В доменной архитектуре обычно не дублируется - продублировался только в 2 белках из 84. Имеет более менее стабильную длину, но с тенденцией к укорачиванию. При поверхностном осмотре кажется, что чаще встречается в третьей четверти белка, но далеко не всегда
3D	4	Пространственная структура в основном представлена β-листами
taxonomy	bacteria: 3k others: 0	Домен втречается только у бактерий

Карта локального сходства

AC белка с доменной архитектурой 1:	A0A0H2KRT3
Доменная архитектура 1:	AC: PF13385 - PF20578 - PF07944 - PF20736 - PF20620 - PF12733 ID: Laminin_G_3 - aBig_2 - Beta-AFase-like_GH127_cat - Glyco_hydro127M - DUF6805 - Cadherin-like
AC белка с доменной архитектурой 2:	I8YUX9
Доменная архитектура 2:	AC: PF07944 - PF20736 - PF20737 - PF20620 ID: Beta-AFase-like_GH127_cat - Glyco_hydro127M - Glyco_hydro127C - DUF6805

Комментарий в виде рисунка на последней картинке

В доменах присутствуют локальные изменения (линии на карте прерываются внутри доменов), но в целом все хорошо. Ну и примерно с 900 по 1000 а.к на A0A0H2KRT3 долен быть домен Glyco_hydro127C, тк участок очень похож на этот домен в I8YUX9. Но на Pfam это не указано, что весьма странно. Теряюсь в догадках, почему же так вышло

На этом все