Белок GlmU (AC:Q5M0U2) из организма Streptococcus thermophilus

Выбор белка

Белок найден по поиску видового названия организма (Streptococcus thermophilus). Я выбрал его, тк многие другие записи были о CRISPR-Cas системах, и я подумал, вдруг там не только белок будет, а еще и РНК или что-то такое. А это - фермент, так что не должно быть проблем. И еще он красиво выглядит.

Поисковые запросы

1) (organism_id:299768)

Сначала просто смотрим, сколько записей, приуроченных к данному штамму бактерии, чтобы дальше было с чем сравнивать. Нашлось 322 записи

2) (organism_id:299768) AND (keyword:KW-0961)

Выбранный белок GlmU участвует в синтезе клеточной стенки (катализирует две реакции в синтезе N-ацетилглюкозамина). Соответственно можем посмотреть, сколько и какие белки занимаются клеточной стенкой. Таких 13 штук

3) (organism_id:299768) AND (keyword:KW-0961) AND (cc_pathway:cell wall biogenesis)

Теперь смотрим какие белки непосредственно принимают участие в синтезе клеточной стенки. Их уже 11, и нашего белка среди них нет

4) (organism_id:299768) AND (cc_function:N-acetylglucosamine)

Смотрим на белки, функции которых связаны с N-ацетилглюкозамином. Таких 3, включая наш фермент. Два оставшихся присоединяют енол-пируват к уже готовому N-ацетилглюкозамину

5) NOT (organism_id:299768)

253,205,848 записей. UniProtKB содержит в 786,354 раза больше записей не относящихся к рассматриваемому организму, чем относящихся