Gap_penalty: 10.0 Extend_penalty: 0.5 Length: 283 Identity: 224/283 (79.2%) Similarity: 252/283 (89.0%) Gaps: 6/283 ( 2.1%) Score: 1179.5Готовое выравнивание было импортированно в GeneDoc.
Сравните полученное предсказание с данными ОРМ. Рассмотрите полученное выравнивание, и заполните таблицу вида:
Результаты предсказания топологии мембранного белка Q6CZ87
Число а.к. остатков | |
Всего а.к. остатков | 279 |
Остатки, предсказанные как локализованные в мембране (всего) | 135 |
Правильно предсказали (true positives, TP) | 114 |
Предсказали не то, что нужно (а.о. предсказаны как мембранные, а по данным ОРМ таковыми не являются, false positives, FP) | 21 |
Правильно не предсказали ( не предсказаны, и по данным ОРМ не находятся в мембране, true negatives, TN) | 117 |
Не предсказали то, что нужно (остатки по данным ОРМ находятся в мембране, false negatives, FN) | 27 |
Чувствительность (sensivity) = TP / (TP+FN) | 0.8 |
Специфичность (specificity) = TN / (TN+FP) | 0.85 |
Точность (precision) = TP / (TP+FP) | 0.844 |
Сверхпредсказание = FP/ (FP+TP) | 0.155 |
Недопредсказание = FN / (TN+FN) | 0.1875 |