Учебный сайт
Заиры Сефербековой

Краткое описание генома археи Thermococcus kodakarensis KOD1

Краткая характеристика[1]:

Более подробная информация.

Слева: общий вид Thermococcus kodakaraensis, фотография F. Fukuri, Университет Киото [2].
Справа: фотография ДНК археи с полисомами (сделана с помощью техники Миллера) [3].
Фото археи Фото ДНК археи

Thermococcus kodakarensis — архея, живущая в бескислородной среде при высокой температуре (оптимум: 80-95oC). Элементарная сера необходима для развития археи, либо стимулирует ее рост. Протеины этого микрорганизма исследуются для выявления термостабильных ферментов и дальнейшего использования их в биотехнологии [1].
Архея Thermococcus kodakarensis имеет непостоянную сферическую форму, размер около 1-2мкм. Способна передвигаться с помощью нескольких полярных жгутиков. Оболочка липидная. Микроорганизм использует аминокислоты, пептиды, пируваты и крахмал в качестве источника углерода и энергии. Метаболические процессы, происходящие в T. kodakarensis, включают глюконеогенез и гликолиз; продукты метаболизма: водород и сероводород.
T. kodakarensis играет важную роль в экологии морских гидротермальных источников, в которых обитает[2].

Вы можете узнать больше информации об одном из белков данной археи здесь.

Таблица 1. Распределение длин белков из генома археи Thermococcus kodakarensis KOD1
Интервал Количество
1..100 305
101..200 656
201..300 519
301..400 386
401..500 236
501..600 70
601..700 53
701..800 30
801..900 19
901..1000 8
>1000 24
Всего 2306

Согласно данным, приведенным в таблице, данной архее характерны белки длиной до 500 а.о. Чаще всего встречаются белки длиной от 100 до 200 а.о. и от 200 до 300 а.о.

Источники:

[1] Краткая характеристика Thermococcus kodakarensis // National Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Thermococcus+kodakarensis+KOD1+)
[2] Краткая характеристика Thermococcus kodakarensis // MicrobeWiki (https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Thermococcus_kodakarensis)
[3] French SL, Santangelo TJ, Beyer AL & Reeve JN (2007). Transcription and translation are coupled in Archaea. Mol Biol Evol, 24, 893−895 PMID 17237472