Учебный сайт
Заиры Сефербековой

Краткое описание генома вируса
Potato virus A

Систематическое положение[1]:

  1. Viruses
  2. ssRNA viruses
  3. ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage
  4. Potyviridae
  5. Potyvirus

Другие названия:

Подробная информация

Potato virus A или А вирус картофеля был описан Мерфи и МакКеем в 1932 году. Вирус поражает семейство Пасленовые (Solanaceae).Переносится PVA преимущественно тлями (около семи видов). Широко распространен в картофелепроизводящих районах. Вызывает мельчание клубней, небольшое снижение урожая. Часто встречается в растении совместно с вирусом PVX, при этом потери урожая значительно увеличиваются. Внешнее проявление заражения PVA - мягкая мозаика, с осветлением или пожелтением участков листовой пластинки. Вирус может быть легко обнаружен в соке зараженного табака, но не в соке зараженных растений картофеля[2]. Контроль заболевания - посадка здоровых клубней, уничтожение тлей и больных растений, аккуратность при резке, посадке и полевых работах[3].
Остальную информацию о структуре генома можно посмотреть в таблице. Также Вы можете посмотреть, как устроена аминокислотная последовательность одного из белков.

Растения, которые могут быть заражены вирусом[2]:

Штаммы различаются вирулентностью к картофелю. Таким образом, Nicandra physalodes может быть разделен на четыре группы (по ущербу для растения): очень слабый, слабый, умеренный, тяжелый.
PVA родственнен potato virus Y, henbane mosaic и tobacco etch viruses, хотя трудно сказать точно, так как результаты реципрокных гетерологических тестов не всегда одни и те же[2].

Фотографии:

Некроз тканей в зараженном листе Solanum demissum. Слева: общий вид; справа: вид вблизи.
Зараженный лист Зараженный лист


Изучение структуры белка капсида [4]

Группа ученых занималась исследованием строения капсида PVA. Они бомбардировали частицы А вируса картофеля термически активированными атомами трития, чтобы по внутримолекулярному распределению меченых атомов определить пространственную доступность аминокислот в составе капсида. Этот метод показал, что 15 аминокислот с N-конца белка и аминокислоты с 27 по 50 являются наиболее доступными для маркировки атомами трития. Пространственная модель расположения полипептидной цепи белка капсида была получена из описанных выше экспериментальных данных в сочетании с предсказаниями вторичной структуры элементов и принципов упаковки альфа-спиралей и бета-листов в белках. Модель описывает три области третичной структуры: доступную область N-конца, содержащую 8 аминокислот и два бета-листа; область на C-конце, включающую две альфа-спирали и три бета-листа и формирующую двухуровневую структуру (ABCD); центральную область, содержащую пучок из четырех альфа-спиралей (подобно обнаруженному в капсиде вируса табачной мозаики). Это первая модель трехмерной структуры капсида Potyvirus.

Таблица 1. Основные параметры генома вируса Potato virus A
Параметр Значение
Латинское название вируса Potato virus A
Русское название вируса А вирус картофеля
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 9585
Количество кодируемых в геноме белков 2

Аминокислотная последовательность одного из белков Potato virus A 
>YP_006395324.1 PIPO
NLLEPVGGFMARVKLFWKISSNKTFAKVLHCGYNCCQARKARRLRRNLRYILSVCTGQTD
GILQESSLSGCEWIASPIQQHH

Наверх ^


Источники:

[1] Taxonomy navigation, UniProt
[2] Potato virus A, Bartels, Phytopath. Z. 21: 395, 1954; etc.
[3] Вирусные болезни картофеля, С. Н. Еланский
[4]A Coat Protein Subunits as Assessed by Tritium Bombardment, Ludmila A. Baratova, Aleksander V. Efimov, Eugenie N. Dobrov, Reet Hunt and others, J. Virol. October 2001 vol. 75 no. 20 9696-9702