Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова Факультет Биоинженерии и Биоинформатики Учебный сайт Сеферяна Мелика |
---|
Полезные ссылки |
Кристаллографическая симметрия.Дана запись 1MNM.pdb.1. В поле COMPND найдена следующая информация о биополимерах, присутствующих в записи: Две комплементарные цепочки ДНК - E и F. Молекула белка - регулятора транскрипции MCM1 - цепи A и B. Молекула белка - репрессора транскрипции MAT ALPHA-2 - цепи C и D. 2. Изучение водородных связей цепи D в пределах ассиметрической единицы. 3. Теперь изучим связи цепи D с молекулами, находящимися в соседних симметрических образах асимметрической единицы. а) связь цепи D с ДНК, содержащейся в той же ассиметрической единице, и восстанавливаемой по симметрии кристалла: б) связь цепи D с белками из других образов ассиметрической единицы: Получается, что в кристалле каждая цепь D взаимодействует с 4 цепями ДНК и с 3 цепями белка, причем с одной из цепей А ( не в ассиметрической единице ) она образует параллельный бета-слой. |