Поиск блоков во множественном выравнивании

Поиск блоков во множественном выравнивании

В сервисе Pfam я нашла домен PagP и скачала выравнивание 30 последовательностей. Затем я привела множественное выравнивание в порядок: удалила последовательности с протяженными вставками или делециями в середине, колонки из одних гэпов и т.д. В результате получилось множественное выравнивание из 9 последовательностей, в котором нашлось 4 консервативных блока:

Oops

Oops

Oops

Oops

В данном выравнивании имеется достаточное количество блоков, находящихся на небольшом расстоянии друг от друга, из чего можно сделать вывод о гомологичности данных последовательностей.

  • Выравнивание