Геномные браузеры

UCSC

Имя гена ETNK2
Идентификатор гена в Gencode ENSG00000143845.15
Цепь Обратная
Хромосома 1
Плечо и полоса q32.1
Альтернативных продуктов 7
Идентификатор gencode Координаты Число экзонов Длина белка
ENST00000367201.7
chr1:204,131,062-204,151,894 8 394
ENST00000367202.9 chr1:204,131,062-204,152,044 8 386
ENST00000367197.5 chr1:204,131,956-204,141,262 5 68

Oops

Ensembl

С помощью Ensembl я получила выравнивание гена белка ETNK2 человека и шимпанзе. С помощью команды infoalign ‑only ‑diffcount Human_Chimpanzee_lastz.fasta out.txt я получила количество отличий: 209. Таким образом процент различий равен (209/21014)*100% = 0.99%, что в целом соответствует данным из интернета.