Кристаллическая структура двух порового домена калиевого ионного канала K2P1 человека (TWIK-1).
Достаточно известный факт о содержании данных белков у человека и других животных.
Двухпорые доменные калиевые каналы (K (+)) - это постоянно открытые или конститутивно
присутствующие в мембране каналы(такие как каналы покоя или
протекающие каналы),которые контролируют
отрицательный потенциал покоя эукариотических клеток и регулируют
возбудимость клеток,
проводя ионы K (+) через плазматическую мембрану.Блокаторами являются -
бупивакаин,
хинидин.Активаторами- галотан.
В отличие от других канальных структур K (+), K2P1 является димерным. В
неклеточный колпачковый домен, расположенный над селективным фильтром,
образует ионный путь, в котором ионы K(+)
текут через боковые порталы.
Предсказание трансмембранных участков при помощи сервиса TMHMM.
Всего в выдаче TMHMM наблюдается 6 трансмембранных участков. Алгоритм валиден и это с высокой вероятностью трансмембранный белок,
так как чередуются (outside и inside) фрагменты.
Мы видим не очень хороший фрагмент 2.Он может объясняться
разными факторами, к примеру фрагмент: изменением сродства к мембране со временем.Результат совпадает с известными данными.
Структура белка в банке PDBTM
