| На рисунке изображен лиганд
фосфоенолпируват(он расположен
посередине - молекула оранжевого, серого и
красного цвета), желтыми шариками
изображены молекулы воды, а
пунктирными линиями - водородные связи.
Серыми шариками изображены
гидрофобные связи. Чтобы получить такое
изображение в raswin нужно выполнить
следующие команды:restrict none
background white
define M pep and within(4.0, *A)
echo the set M is defined
echo ok
select m
wireframe 80
zoom 700
center m
select within (3.5, M) and not water
wireframe 80
bond 1408 10506
bond 2006 10505
bond 10505 10506
bond 1408 10509
bond 1752 10512
bond 10509 10506
bond 10509 10505
bond 10511 10512
bond 10513 10512
bond 10513 10511
bond 1408 10513
bond 10513 1752
bond 10513 1749
bond 10509 10513
bond 10509 10512
bond 10509 10511
bond 2006 10509
select within (3.5, m) and water
color yellow
cpk 100
bond 10505 11303
bond 11303 10741
bond 10509 10817
bond 1752 10817
bond 10512 10817
bond 10512 11303
bond 10731 1408
bond 10731 10770
bond 10509 10770
bond 10738 10511
bond 10511 10770
bond 10506 10731
bond 1752 1749
bond 10817 11303
bond 10741 10505
define l within (3.5, m) and not water
echo the set l is defined
echo ok
select within (5.0, m) and not water and
not l
cpk 100
color grey
|
Главная страница первого семестра