Главная страница второго семестра

Мотивы в белке aroG_ECOLI, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE casein kinase II phosphorylation site паттерн [ST] - x(2) - [DE] неспецифична 2
PS00008 MYRISTYL N-myristoylation site паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} неспецифична 9
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION N-glycosylation site паттерн N - {P} - [ST] - {P} неспецифична 6
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Protein kinase C phosphorylation site паттерн [ST] - x - [RK] неспецифична 6
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Tyrosine kinase phosphorylation site паттерн [RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y неспецифична 1
В базе данных Prosite я нашла мотивы, встречающиеся в белке aroG_ECOLI. По этим мотивам можно найти родственные белки или сам белок. По тому, специфична ли подпись, можно определить, часто ли встречается данный мотив, или он специфичен для семейства. По описанию всех мотивов в белке можно определить его функцию и примерную аминокислотную структуру.


©Надя Шашина