Создание паттернов для поиска и распознавания аминокислотных последовательностей

Фрагмент выравнивания, по которому строились паттерны:

aroG_CORGL> ADIFAGDDDRLVVVV

aroG_ECOLI> HKILKGNDDRLLVVI

aroG_HAEIN> HNIIHGKDDRLLVVI

aroG_YEAST> IDIITGKDDRVLVIV

aroG_CANAL> AQILKGNDDRCIVIV

Поиск по паттернам в банке данных SwissProt

Характеристика паттерна	Паттерн	В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну?	Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены?
Фрагмент последовательности	HKILKGNDDRLLVVI	2 - ECOLI и ECO57	нет
Сильный	[AVHI]-[DNKQ]-I-[FLI]-[AHKT]-G-[DNK]-DDR-[LVC]-[VLI]-V-[VI]	7 (кроме моих 6, еще ECO57)	Да
Слабый	I-[FLI]-X-G-[DNK]-DDR-[LVC]-[VLI]-V-[VI]	7	Да

В результате поиска и по сильному, и по слабому паттернам были найдены только последовательности, использованные в создании паттерна. Вообще, паттерны создаются, чтобы найти нужные последовательности, поэтому сильный паттерн должен быть более эффективным.