blosum62.xls - книга Excel состоит из трех листов:
на первом листе представлена матрица blosum62, в которой аминокислоты разделены по группам. Вес замен аминокислот внутри групп считается так, в матрице замен группы берется треугольник чисел над главной диагональю, эти числа складываются, а затем делятся на количество взятых чисел. Вес замен внутри группы A, G, S, T равен 0, внутри группы N, D, E, Q равен 0,83. Средний вес замен между аминокислотами разных групп равен сумме всех чисел, находящихся в матрице, поделенной на количество этих чисел. Сердний вес замен между аминокислотами групп A, G, S, T и N, D, E, Q равен -0,81. Вывод: в группах аминокислот с похожими свойствами средний вес замен больше или равен нулю, а с непохожими - меньше нуля.
на втором листе представлена таблица, в которой обозначено количество пар аминокислот блока AroFGH, были выбраны 3 пары аминокислот, между которыми был рассчитан вес замен. Для рассчета была использована формула
Главная страница второго семестра