строилась для двух последовательностей: последовательность первых четырех остатков белка aroG_ECOLI и искусственно созданная последовательность из пяти букв, полученная из тех же четырех остатков с помощью двух замен и вставки одной буквы. Параметры для построения схемы переходов: вес совпадения = 2, вес замены = -1, штраф за гэп = -2. Оптимальному пути соответствует выравнивание:
M N Y - Q
C N H T Q
Вес выравнивания получился равным -2.
©Надя Шашина
Главная страница второго семестра