Главная страница третьего семестра

Аннотация генов

Для того, чтобы определить, кодирует ли заданный мне фрагмент что-либо, похожее на какой-либо белок из прототипного организма, я использовала программу blastx, потому что именно эта программа позволяет сравнивать последовательность нуклеотида с последовательностями белков.

Команды, использованные для определения расположения генов:

В результате нашлось 20 фрагментов нуклеотида, гомологичных белкам, но большинство из них пересекаются, значит, на фрагменте закодировано всего два белка.

Гипотетические гены в фрагменте 1-4000

3`-[<=ген Q8ZP38_SALTY 3-1454]-[<=ген Q8ZP37_SALTY 1475-4000]-5`
5`------------------------------------------------------------3`

С помощью SRS я установила взаимное расположение генов, и схема стала выглядеть так:

3`-[<=ген narH 11007..12556]-[<=ген narG 12539..16380]-5`
5`-----------------------------------------------------3`


©Надя Шашина