Краткое описание белка моей бактерии

Информация о белке

Белок, с которым я работаю, является гликозилтрансферазой. Такие протеины присутствуют практически во всех организмах и занимаются формированием гликозидных связей между активированными сахарами и акцепторами сахарной или несахарной природы.
Сахар активируется присоединением к нему нуклеотид-фосфатов. Гликозилтрансферазы проявляют высокую субстратную спецефичность. Гликозилтрансферазы разделяют по семействам на основании молекулярно-генетических данных. Мой белок принадлежит к семейству 1 [1]
Данный белок участвует в синтезе липополисахаридов для клеточной стенки. Его функцию установили методом компьютерного анализа последовательности.
Ген белка находится в рамке считывания +3 и начинается с обычного старт-кодона. Слева от него находится другая гликозилтрансфераза, а справа - А-изомераза рибозо-5-фосфата. [2]

Таблица 1 Описание белка (гликозил трансферазы семейства 1) из генома бактерии.

Параметр	Значение
Идентефикатор белка	ADX55361.1
Идентефикатор фрагмента генома	NC_015136
Координаты гена в геноме	2207082..2208401
Длина гена (п. н.)	1320
Цепь (прямая или обратная)	прямая
Длина белка (в аминокислотныз остатках)	439

Здесь содержится аминокислотная последовательность описанного полипептида этой бактерии.

>ADX55361.1 glycosyl transferase group 1                                                      
MRPTLDASPLAHSLPLVAPACIDPAAAPLGSGIAASAAVHKAALPHVLFVDQSGQLGGAE
FALLQLAEHYPSHMEVVLLADGPFRLRLEALGARVQIINDASVSGIARQASALNCLRVLP
GIVRQVRAIAARAQAFDMLFVNTQKALVLGALGKALHRKPVVWYQHDILTREHFGRVQLA
VVKWAVRLAVDQVIVNSRASAKSLAALTGRAADTAPVVYNGIDASAFNCVDGTDMGMLRQ
RLGLPEHAWLAGLFGRLAPWKGQHIALEALTRLPDAHLVLVGAPLFGEDAYAQRLRDEAS
ALGIAERVHFAGFQDDIPAWMKAMNVILHTSTEPEPFGRVIVEGMAAGRPVIAAAAGGVT
EIVRHGRNGWLVKPGDAAVLADAIGVLRNDPALAQRLAQQALLDAQAEFSVDQYVQRMMD
ALSKAVKRRDGEANAQTSP

Рисунок 1 Геномное окружение гена, кодирующего этот белок

Источники

[1] Structures and mechanisms of glycosyltransferases, Glycobiology, 21.07.2005
[2] NCBI database