Для выполнения задания был выбран путь биосинтеза рибофлавина и связанных кофакторов. Его номер в базе данных KEGG 00740. Изображение этого пути представленно ниже.
Данный путь необходим организмам для получения кофакторов окислительно-восстановительных реакций: флавинадениндинуклеотида (FAD) и флавинмононуклеотида (FMN). Исходным сырьем служат ГТФ(красный), поступающий из синтеза пуринов, и рибулозо-5-фосфат(зеленый) из пентозофосфатного пути. Также этот путь связан с биосинтезом пигментов порфиринов и хлорофиллов через диметилбензимидазол(голубой). Другой побочный продукт - рибитол(желтый) испльзуется во взаимопревращениях пентоз.
Выбран Loxodonta africana (Африканский слон)
Царство: Metazoa
Отдел: Chordata
Класс: Mammalia
Отряд: Proboscidea
Семейство: Elephantidae
Выбран Haloferax mediterranei
Отдел: Euryarchaeota
Класс: Halobacteria
Отряд: Haloferacales
Семейство: Haloferacaceae
Выбран Prochlorococcus marinus штамма MED4
Отдел: Cyanobacteria
Отряд: Synechococcales
Семейство: Prochloraceae
Млекопитающие зависят от поступления рибофлавина(витамина В2) в организм, так как не способны его самостоятельно синтезировать, а только осуществляют несколько реакций взаимопревращений. В самостоятельно живущих бактериях присутствуют большинство реакций центрального пути этого биосинтеза. Возможно, отсутствие фермента 3.1.3.104 в нескольких записях связано с неточностями аннотации базы, так как биологический смысл отсутствия такой ключевой реакции неясен. В архее присутствуют альтернативные пути синтеза и центральные реакции.
Идентефикатор: R09520. Она выделена фиолетовым на первом изображении. Также в базе учтена такая же реакция для НАД и отображены изменения системы связей в молекуле.
