Данное задание проверяет усвоение двух понятий: ассиметрическая ячейка и биологическая единица. Ассиметрическая ячейка - это минимальная часть структуры из которых путем нетрасляционных и трансляционных симметрий можно восстановить кристалл. Биологическая единица - минимальная часть белка, выполняющая функцию этого белка.

Биологическая единица - часть содержимого асимметрической ячейки

На сайте rscb.org с помощью запроса Number of Chains Search : Min Number of Chains=2 Max Number of Chains=2 and Oligomeric state Search : Min Number of oligomeric state=1 Max Number of oligomeric state=1 было получено 14936 результатов. Я выбрал структуру 3VKH - функционального полноразмерного моторного домена диенина. Он осуществляет свою функцию будучи мономером (Рис 2), однако при кристаллизации мы видим димер (Рис 1).

Рисунок 1.Содержимое ассиметрической ячейки белка 3VKH.

Рисунок 2. Биологическая единица белка 3VKH.

Биологическая единица больше содержимого ассиметрической ячейки

На сайте rscb.org с помощью запроса Number of Chains Search : Min Number of Chains=1 Max Number of Chains=1 and Oligomeric state Search : Min Number of oligomeric state=2 Max Number of oligomeric state=2 было получено 10458 результатов. Я выбрал структуру 4UHW - человеческой оксидазы альдегидов. Данный белок функционирует в виде димера (Рис 4), однако в его ассиметрической ячейке содержится только одна цепь (Рис 3). В данном случае можно восстановить структуру полностью, если повернуть мономер на 180 градусов.

Рисунок 3.Содержимое ассиметрической ячейки белка 4UHW.

Рисунок 4. Биологическая единица белка 4UHW.