Отчет по практикумам 1 и 2
Отобранные организмы
| Название организма | Мнемоника |
| Acidothermus cellulolyticus | ACIC1 |
| Bifidobacterium longum | BIFLO |
| Corynebacterium diphtheriae | CORDI |
| Leifsonia xyli | LEIXX |
| Mycobacterium tuberculosis | MYCTU |
| Streptomyces avermitilis | STRAW |
| Thermobifida fusca | THEFY |
Скобочная форма дерева
((((STRAW, THEFY), ACIC1), (LEIXX, BIFLO)), (MYCTU, CORDI));
Изображение дерева
Ветви дерева
Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:
1) {CORDI, MYCTU} против {BIFLO, LEIXX, ACIC1, THEFY, STRAW}
2) {BIFLO, LEIXX} против {CORDI, MYCTU, ACIC1, THEFY, STRAW}
3) {THEFY, STRAW, ACIC1} против {LEIXX, BIFLO, MYCTU, CORDI}
4) {THEFY, STRAW} против {ACIC1, LEIXX, BIFLO, MYCTU, CORDI}
Реконструкция филогении
При помощи сервиса NCBI Taxonomy для каждой из рассматриваемых бактерий были определены следующие таксономические группы (перечислены от высшей к низшей):ACIC1: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Acidothermales; Acidothermaceae; Acidothermus
BIFLO: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Bifidobacteriales; Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium
CORDI: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium
LEIXX: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia
MYCTU: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium tuberculosis complex
STRAW: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces
THEFY: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida
Все отобранные бактерии входят в таксономические группы: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes. Низшая таксономическая категория, к которой относятся все бактерии Actinomycetes имеет ранг класса. Ветвь, ведущая к CORDI и MYCTU отражает порядок Mycobacteriales.