Было выбрано семейство PF16361 - S8-N-пептидаза. В нем 214 последовательностей вообще и 35 в seed.
В семействе 31 архитектура: одна представлена 112-ю последовательностями, следующая по распространенности - 58-ю последовательностями, а все остальные содержат меньше десяти (почти все 1, 2 или 3).
Домен встречается на N-конце некоторых протеаз, чаще всего бактериальных. Составляет около 100 аминокислотных остатков, выполняет неизвестную пока функцию.
Здесь можно скачать выравнивание seed. Абсолютно консервативные аминокислоты: 69, 158, 159, 163. Можно считать блок 158-163 максимальным достоверным для всех последовательностей.
Для всех последовательностей кроме R6VKJ_9BACT/51-194, PSSJ80_9BACE/45-188, R6EGL1_9BACE/49-191 этот блок можно расширить и считать 158-165 максимальным достоверным. Других достоверных блоков для этого подмножества последовательностей нет.
На участке 111-145 нет достоверных подблоков (или очень короткие, включающие небольшую часть последовательностей), поэтому можно сказать что этот участок никак не отражает течение эволюции.
Сильнее всего отражают ход эволюции участки 53-55, 68-74, 146-150 и 158-165, между ними встречаются иногда одиночные позиции, обладающие высоким процентом идентичности. Возможно, это аминокислота активного центра. В остальном за пределами этих позиций идентичность отсутсвует вовсе или включает в себя далеко не все последовательности. Не удалось выделить группу последовательностей, имеющих заметно большее сходство между собой, чем с остальными по всей длине выравнивания.