Практикум 3

PDB ID: 1UFR

Структура в целом

тут 3D структура белка из PDB

Представлен протеин TT1027 из Thermus thermophilus HB8. Это мРНК-связывающий белок. Полимер состоит из 4 цепей: A, B, C, D, все идентичны по последовательности, каждая содержит 181 аминокислотный остаток.

Биологическая единица - гомодимер. Каждая субъединица состоит из одной цепи. Две биологические единицы могут связываться в тетрамер. (Возможно, для регуляции работы белка)

Отдельные цепи

Все 4 цепи относятся к Thermus thermophilus. Uniprot-id: Q5SK65. (общий т. к. цепи идентичны по последовательности)

Пептиды регулируют аттенюацию транскрипции пиримидинового оперона. Могут выступать в виде репрессора трансляции.

Ни одной мутации относительно референса Uniprot нет (замену метионина на селенометионин мутацией не считаем).

Селенометионин - единственный модифицированный аминокислотный остаток. Встречается на позициях 1, 8, 13 цепи. О селенометионине в файле PDB

Малых молекул 2:

О малых молекулах в файле PDB