Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
| № | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) |
|---|---|---|---|
| Альфа-спирали | |||
| 1 | N(38ALA)-O(34ASP) | 3.01 | 147.8 |
| 2 | N(20GLY)-O(16THR) | 2.98 | 117.6 |
| 3 | N(68HIS)-0(64TYR) | 2.86 | 159.1 |
| Бета-тяжи | |||
| 4 | N(140ILE)-O(144GLY) | 2.98 | 157.9 |
| 5 | N(144GLY)-O(140ILE) | 2.94 | 151.5 |
Длина водородной связи близка к 3Å (в среднем 2,95Å) как в α-спиралях, так и в β-тяжах.
Угол N-H-O в α-спиралях составляет в среднем 141,5°, а в β-тяжах - 154,7° (но следует понимать, что выборка маленькая, а разброс между ними достаточно большой). Идеальный угол водородной связи состаляет 180° ± 45°.
Таким образом, полученные результаты в целом согласуются с теоретическими данными.
Ссылки:
1.Основы биохимии Ленинджера : в 3 т. Т. 1 : Основы биохимии, строение и катализ