Bacillus anthracis | BACAN |
Bacillus subtilis | BACSU |
Clostridium botulinum | CLOBA |
Clostridium tetani | CLOTE |
Enterococcus faecalis | ENTFA |
Geobacillus kaustophilus | GEOKA |
Lactobacillus acidophilus | LACAC |
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | LACDA |
Скобочняа формула дерева
((((BACAN,BACSU),GEOKA),((LACAC,LACDA),ENTFA)),(CLOBA,CLOTE))Изображение дерева
![pr1](pr1tree.png)
Нетривиальные ветви дерева
{BACAN,BACSU} против {GEOKA,ENTFA,LACAC,LACDA,CLOBA,CLOTE}
{BACAN,BACSU,GEOKA} против {ENTFA,LACAC,LACDA,CLOBA,CLOTE}
{BACAN,BACSU,GEOKA,CLOBA,CLOTE} против {LACAC,LACDA,ENTFA}
{BACAN,BACSU,GEOKA,ENTFA,CLOBA,CLOTE} против {LACDA,LACAC}
{BACAN,BACSU,GEOKA,ENTFA,LACAC,LACDA} против {CLOBA,CLOTE}
Таксономия выбранных бактерий
BACAN,BACSU - род Bacillus
CLOBA,CLOTE - род Clostridium
LACAC,LACDA - род Lactobacillus
ENTFA,LACAC,LACDA - Lactobacillales
BACAN,BACSU,GEOKA - Bacillaceae
![pr1](pr1tree_1.png)
Белочечки
Был выбран фактор высвобождения пептидной цепи 1 с мнемоникой RF1.
Скачать выравнивания последовательностей
этого белка из выбранных ранее бактерий.
Maximum likelihood
Minimum evolution
Neighbor joining