Практикум 10

Выравнивание геномов

AC организмов я искал с помощью сайта NCBI, выбирая уровень сборки не ниже хромосомного. Я выбрал геномы следующих прокариотических организмов Escherichia coli str. K-12 и Escherichia coli O157. У каждого организма по одной хромосоме.


Escherichia coli str. K-12 (ось Х) и Escherichia coli O157 (ось Y); Выравнивание с помощью алгоритма blastn:




Escherichia coli str. K-12 (ось Х) и Escherichia coli O157 (ось Y); Выравнивание с помощью алгоритма megablast



Так как организмы близкородственные мы можем видеть отличное выравнивание геномов, которое наблюдается практически на всем участке