Главная
Учебные материалы

Альфа-спираль

helix13 (обозначенная скриптом ss.def ) - сама длинная альфа-спираль цепи B. (аналогичные спирали содержатся в остальных трех цепях)
Изображение спирали наложено на остовную структуру цепи B

Информация о торсионных углах спирали

В принципе можно выделить зону скопления пар углов остатков helix13, причем эта зона весьма типична для всех альфа-спиралей

Информация о паттерне водородных связей спирали

Откуда очевидно паттерн H(i,i+4)
В данной спирали присутствует явление Beta-Bulge (Бета-выпуклости): Когда один из атомов образует 2 водородных связи вместо одной (O из PRO232).

Информация о взаимодействии спирали с остальной частью белка

На рисунке, отображающем расположение атомов белка относительно спирали, видно что контакты расположены неравномерно
©Залевский, Артур, 2007