Альфа-спираль |
helix13 (обозначенная скриптом ss.def ) - сама длинная альфа-спираль цепи B. (аналогичные спирали содержатся в остальных трех цепях) |
| Изображение спирали наложено на остовную структуру цепи B |
Информация о торсионных углах спирали |
| В принципе можно выделить зону скопления пар углов остатков helix13, причем эта зона весьма типична для всех альфа-спиралей |
Информация о паттерне водородных связей спирали |
| |
Откуда очевидно паттерн H(i,i+4) |
В данной спирали присутствует явление Beta-Bulge (Бета-выпуклости): Когда один из атомов образует 2 водородных связи вместо одной (O из PRO232). |
Информация о взаимодействии спирали с остальной частью белка |
| |
На рисунке, отображающем расположение атомов белка относительно спирали, видно что контакты расположены неравномерно |