Занятие 7

Задание 1

ID фермента: AK1A1_HUMAN, Alcohol dehydrogenase (NADP(+)), Алкоголь дегидрогеназа.
EC 1.1.1.2
Oxidoreductases; Acting on the CH-CH group of donors; With other acceptors
Класс=1, Оксидоредуктазы; Подкласс=1, Действующие на CH-OH группу доноров; Подподкласс=1, С NAD+ или NADP+ в качестве акцепторов.
Катализируемая реакция:
An alcohol + NADP(+) <=> an aldehyde + NADPH

Задание 2

Таблица белков мыши с EC
Всего 545 белка.
Подкласс совпадает у 113 белков(1.1.*)
Подподкласс совпадает у 95 белков(1.1.1.*)
Вся классификация совпадает у 1 белка (1.1.1.2).
Последовательности белков мыши в fasta формате
Результаты Blastp:

Sequence	E-value	EC number
AK1A1_MOUSE	0.0	1.1.1.2
ALDR_MOUSE	6e-104	1.1.1.21
ALD2_MOUSE	7e-103	1.1.1.21
ALD1_MOUSE	3e-101	1.1.1.21
AK1D1_MOUSE	2e-100	1.3.1.3
DHB5_MOUSE	4e-91	1.1.1.-
AKCL2_MOUSE	8e-91	1.1.1.263
AK1CD_MOUSE	3e-89	1.1.1.-
AKC1H_MOUSE	7e-87	1.1.-.- or 1.1.1.149
AK1CL_MOUSE	2e-86	1.1.1.-

10 находок можно считать "хорошими".
Единственным исключением из-за несовпадения по подклассу стал AK1D1_MOUSE, в остальном наблюдается полное совпадение вплоть до подподкласса.