Учебный сайт Карины Сим
  • Главная
  • Семестры
  • Обо мне
  • ФББ

    Практикум 3

    Структура в целом

    В данном практикуме рассматривается белковая молекула (pdb_id: 6M8A).

    Рисунок 1
    Рисунок 1. Общий вид структуры белка 6M8A.

    В структуре присутствует одна полимерная цепь. Этот белок является мономером. Биологическая единица не отличается от ассиметрической.

    Отдельные цепи

    Это белок человека Homo sapiens.

    Uniprot_id: Q8NFU5

    Это инозитол-полифосфат-мультикиназа (Inositol polyphosphate multikinase).

    В последовательности нет мутаций относительно референса Uniprot.

    В составе цепи есть два модифицированных аминокислотных остатка: N-ацетил-аланин (N-acetylalanine) на 2 позиции и фосфосерин (phosphoserine) на 7 позиции.

    Рисунок 2
    Рисунок 2. Вторичная структура белка 6M8A.

    Малые молекулы

    У данного белка есть лиганд.

    Краткое название: LU2.

    Полное название: 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one.

    Файл с соответствующими строками из файла pdb.

    Рисунок 3
    Рисунок 3. Белковое окружение лиганда LU2.