Практикум 3
Структура в целом
В данном практикуме рассматривается белковая молекула (pdb_id: 6M8A).
Рисунок 1. Общий вид структуры белка 6M8A.
В структуре присутствует одна полимерная цепь. Этот белок является мономером. Биологическая единица не отличается от ассиметрической.
Отдельные цепи
Это белок человека Homo sapiens.
Uniprot_id: Q8NFU5
Это инозитол-полифосфат-мультикиназа (Inositol polyphosphate multikinase).
В последовательности нет мутаций относительно референса Uniprot.
В составе цепи есть два модифицированных аминокислотных остатка: N-ацетил-аланин (N-acetylalanine) на 2 позиции и фосфосерин (phosphoserine) на 7 позиции.
Рисунок 2. Вторичная структура белка 6M8A.
Малые молекулы
У данного белка есть лиганд.
Краткое название: LU2.
Полное название: 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one.
Файл с соответствующими строками из файла pdb.
Рисунок 3. Белковое окружение лиганда LU2.