Практикум 4
Составление списка гомологичных белков
Для начала были выбраны полные протеомы 8 бактерий отдела Pseudomonadota. Далее в выбранных протеомах был произведен поиск достоверных гомологов белка CLPX_ECOLI программой blastp. Порог на E-value = 0,0001.
Список находок:
Реконструкция и визуализация
Последовательности находок были помещены в fasta-файл. Названия были отредактированы таким образом, что остались только ID.