Участок структуры | Позиции в структуре(результаты findpair) | Результаты предсказания с помощью einverted | Результаты предсказания по алгоритму Зукера |
---|---|---|---|
Акцепторный стебель | 5'-1-7-3' 5'-72-66-3' (7) | Не предсказано | 6 пар |
D-стебель | 5'-10-13-3' 5'-25-22-3' (4) | Не предсказано | 4 пары |
T-стебель | 5'-49-53-3' 5'-65-61-3' (5) | 5'-51-54-3' 5'-65-62-3' (4) | 4 пары |
Антикодоновый стебель | 5'-38-44-3' 5'-26-32-3' (7) | 9 пар со смещением на 2 нуклеотида | 5 пар |
Общее число канонический пар нуклеотидов | 20 | 13 | 19 |
Контакты атомов белка с | Полярные | Неполярные | Всего |
---|---|---|---|
остатками 2'-дезоксирибозы | 1 | 42 | 43 |
остатками фосфорной кислоты | 21+2 | - | 23 |
остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки | 7 | 12 | 19 |
остатками азотиcтых оснований со стороны малой бороздки | 5 | 13 | 18 |