На протяжении как прямого, так и обратного прочтения отношение сигнала к шуму примерно 4 к 1. Присутствует довольно значительный разброс
высоты пиков. Однако, стоит отметить, что качество прочтения прямой последовательности значительно хуже, чем обратной.При редактировании
прямого прочтения пришлось внести гораздо больше изменений, чем при редактировании обратного прочтения
Проблемные нуклеотиды в последовательности:
9-ый нуклеотид в обратном прочтении
В обратном прочтении произошло наложение пиков, однако после сравнения с прямым прочтением
можно сделать однозначный вывод и заменить N на t
120-ый нуклетид в прямом прочтении
В прямом прочтении наложилось сразу несколько пиков и программа не смогла определить нуклеотид,
однако, обратившись к обратному прочтению, устанавливаем, что 120-ый нуклеотид это G
141-ый нуклеотид в прямом прочтении
На месте 141-го нуклеотида пик G значитильно выше всех остальных, тем не менее программа
не смогла распознать его. Для того, чтобы убедиться в своей правоте сверимся с обратным
прочтением: действительно 141-ый нуклеотид это G.
151-ый нуклеотид в обратном прочтении
В обратном прочтении сигнал на месте 151-го нуклеотида лишь незначительно выше шума,
поэтому сверяемся с прямым прочтением и меняем N на C.
195-ый нуклеотид в обратном прочтении
В обратном прочтении уровень сигнала значительно выше, поэтому можно определить, что
195-ый нуклеотид в прямом прочтении это A.
Задание 2.Пример плохой хроматограммы
Здесь приведен нечитаемый участок прямой последовательности из задания 1.
Пики широкие и накладывающиеся друг на друга, сигнал находится на одном уровне с шумом и неотличим от него.
