Геномное окружение.База данных GO
Информация о КОГе
Мой белок имеет COG ID:COG1674.
Точность довольно велика, E-value:8.42e-118. Интервал обнаружения 75-1118 остаток.
Всего в белке 1315 остаток. COG называется DNA segregation ATPase и относится к
FtsK/SpoIIIE and related proteins, что можно перевсти, как АТФаза ДНК-сегрегации
в категории FtsK/SpoIIIE и связанные белки
Визуализация геномного окружения
Было получено изображение геномного окружения COG при параметрах Neighborhood Size = 9,
Occurrence Threshold (%) = 20. Фиолетовым обозначен COG1674. Стоит отметить, что окру-
жение достаточно неконсервативно.
Отнесение белка EccC секреторной системы VII типа из Thermomonospora curvata к терминам GO
Найденный в GO белок отличен от оригинального. P-value находки 3.4e-95
Можно заметить, что у белков совпадают крупные участки и функционально
они одинаковы
| Аспект | Идентификатор GO | Название термина | Перевод названия термина | Код типа достоверности |
|---|
| cellular component | GO:0005618 | cell wall | Клеточная стенка | IDA |
| cellular component | GO:0005886 | plasma membrane | Плазматическая мембрана | IDA |
IDA - Inferred from Direct Assay, означает, что было проведено биохимическое или клеточное исследование для аннотации
© Simon Konnov 2018