Фрагмент вторичной структуры

Работа с програмой Rasmol

Исследовалось положение водородных связей на участке 184-219, и так уж исторически склалось что на этом участке присутствуют две альфа-спирали и антипараллельный бета-слой. Выявлен патерн водородных связей для альфа спирали.

Изображение участка

Водородные связи отмечены зелёными пунктирными линиями

Патерн водородных связей для альфа-спирали:
H(i-i+4)
Сb атомы расположены строго вне спирали.

В антипараллельном ?-слое нет столь чёткого правила, но тем не менее видно, что связи идут через 1-2 и последовательности аминокислот в соседних тяжах противоположна направлена.
Cb атомы расположены по разные стороны от слоя и не обнаруживаются между тяжами.

На главную