В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов (раннее в базе данных использовались только они) и профилей-PSSM (теперь это основная форма описания).

С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) было найдено 7 известных типов мотивов, представленных в белке LpxA 17-ю участками.

Описание найденной записи:

* - отмечены часто встречающиеся в белках мотивы, ** - отмечены паттерны мотива, для которого в PROSITE есть еще и профиль (таковых нет).

Выбранный паттерн: [LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIVAC]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)- [STAVR]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIV].

Мотивы LpxA, соответствующие найденному паттерну: IGanAhIgpfCiVGphVeIGegTvLkshV и IGgmTaVhqfCiIGahVmVGgcSgVaqdVS-R-R.

Случайная последовательность , также идеально удовлетворяющая этому паттерну: LGYGVFITTECWVEHGRHIGYTTYVGFFL.